topas

对晶体结构进行高级分析的软件

全谱分析软件TOtal PAttern Solution (TOPAS) 是德国Bruker公司发布的用于对X射线衍射(XRD)谱线和对样品晶体结构进行高级分析的商业软件。

软件语言

Topas命令可以监控系统活动――memory，I/O，paging space，cpu，process。　此命令包含在perfagent.tools文件集里面。

命令使用方法：　topas [ -d number_of_monitored_hot_disks ] [ -h ]　 - ...

Topas命令可以监控系统活动――memory，I/O，paging space，cpu，process。

此命令包含在perfagent.tools文件集里面。

命令使用方法：

topas [ -d number_of_monitored_hot_disks ] [ -h ]

[ -i monitoring_interval_in_seconds ]

[ -n number_of_monitored_hot_network_interfaces]

[ -p number_of_monitored_hot_processes ]

[ -w number_of_monitored_hot_WLMclasses ]

[ -c number_of_monitored_hot_CPUs ]

[ -P | -W ]

参数：

-d：指定要监控的磁盘数。如果屏幕显示的区域足够大的话，这也是磁盘可显示的最大数。当这个数值超出实际安装的磁盘数，仅仅监控并显示安装磁盘的信息。这个参数缺省值为2，如果这个值设为0,将没有磁盘被监控。

-h：显示帮助信息。

-i：设置监控时间的间隔（秒），默认为2秒。

-n：设置被监控的网络接口数。这也是在屏幕上显示的最大网络接口数，当这个值超出了实际安装的网络接口数，仅仅监控并显示安装的网络接口信息。参数缺省值为2，如果这个值设为0,将没有网络信息被监控。

-p：指定被监控的进程数。这也是在屏幕上显示的最大进程数。缺省值为20，如果这个值为0,没见进程信息被监控。得到的这些进程信息是topas的主要开销。如果进程信息不需要，通常使用这个参数指定那些不想要的进程信息。

-w：指明被监控的WLM类的值。这也是在屏幕上显示的最大WLM值，当这个值超出了实际安装的WLM数，仅仅显示那些安装的WLM类的信息，缺省值为2,如果这个值为0,将没有信息显示。

-c：指明被监控的CPU数。这也是在屏幕上显示的最大CPU值，当这个值超出了实际安装的CPU数，仅仅显示那些安装的CPU的信息，缺省值为2,如果这个值为0,将没有信息显示。

-P：显示整个全屏进程显示。显示一系列最繁忙的进程，类似于默认显示的一部分，每个进程仅仅显示几列，可以通过任何列排序。

-W：显示全屏WLM（负载管理器）类。顶部显示一系列WLM类，类似于WLM类的一部分显示。

一些子命令：

a 这个键显示所有被监控的（CPU，network，disk，WLM，process）不同部分。

c 这个键在累积报告和最忙的CPU之间进行切换。

d 这个键在最忙的磁盘和系统总的磁盘活动之间进行切换。

h 显示帮助信息。

n 这个键在最忙的接口和系统总的网络活动之间进行切换。

w 这个键在WLM类的开关之间切换。

p 这个键进程的开关之间切换。

P 这个键用全屏进程显示替换默认的显示。

W 这个键用全屏WLM类显示替换默认显示。

f 移动光标到一个WLM类上，这个键可以在WLM屏幕底端显示一系列进程情况。

q 退出程序。

r 更新显示。

以下是各个部分表示的含义：

Cswitch：在监控期间每秒钟内容转换的次数；

Syscall：在监控期间每秒钟运行系统呼叫的总次数；

Reads：在监控期间每秒钟运行读系统呼叫的次数；

Writes：在监控期间每秒钟运行写系统呼叫的次数；

Forks：在监控期间每秒钟运行派生系统呼叫的次数；

Execs：在监控期间每秒钟运行执行系统呼叫的次数；

Runqueue：等待处理器空闲以便运行的线程平均数；

Waitqueue：等待分页完成的线程平均数；

Readch：在监控期间通过读系统呼叫每秒钟读出的字节数；

Writech：在监控期间通过写系统呼叫每秒钟写入的字节数；

Rawin：在监控期间通过TTYs每秒钟读入的裸字节数；

Ttyout：在监控期间每秒钟写入TTYs的字节数；

Igets：在监控期间每秒钟到节点查找例行程序的呼叫数；

Namei：在监控期间每秒钟路径查找例行程序的呼叫数；

Dirblk：在监控期间通过目录搜索例行程序每秒钟扫描到的目录块数；

PAGING部分显示的是分页每秒钟次数的统计：

Faults：在监控期间每秒钟发生的分页错误总数；

Steals：在监控期间被虚拟内存管理器每秒钟偷走的物理内存4k的帧；

PgspIn：在监控期间每秒钟从分页空间中读取的4k分页数；

PgspOut：在监控期间每秒钟写入分页空间的4k分页数；

PageIn：在监控期间每秒钟读取的4k分页数，这包括从文件系统读操作相关

关于TOPAS

TOPAS简介

全谱分析软件TOtal PAttern Solution (TOPAS) 是德国Bruker公司发布的用于对X射线衍射(XRD)谱线和对样品晶体结构进行高级分析的商业软件。不同于一般search/match(寻峰寻谱)的软件，如EVA，Jade， X‘pert HighScore，Search Match等，TOPAS的主要目的是运用两个世纪以来关于X射线粉末衍射的主要分析方法和研究成果，通过精修(refine)实验条件参数、样品参数、X射线源参数、仪器参数等，用非线性最小二乘法，将各参数卷积计算出的X射线谱线跟实验测得的谱线进行拟合，给出拟合收敛后的各参数作为该实验条件下的实际参数。

TOPAS的主要功能包括单峰拟合Single Line Fitting (SLF)，全谱拟合Whole Powder Pattern Fitting (WPPF)，晶体结构指标化Indexing (迭代最小二乘法LSI，LP-Search法)，全谱结构分解Whole Powder Pattern Decomposition (WPPD，包括Pawley法和Le Bail法)，未知粉末/单晶晶体结构求解Ab-initio structure determination in direct space from powder and single crystal data，Rietveld 结构精修 Rietveld structure refinement，定量Rietveld分析 Quantitative Rietveld analysis等。

粉末衍射分析旗舰

创立的基本参数策略 (fundamental parameters approach)，函数最小化路径 (function minimization routines)和晶体结构求解 (structure determination capabilities) 仅仅是TOPAS软件作为粉末衍射分析旗舰软件的冰山一角。在目前的粉末衍射分析软件市场上，超过2500个科研单位试样TOPAS。

物相分析工业标准

归因于其分析能力，特别是精修处理超大晶体结构和不规则晶体结构的能力，TOPAS已经成为水泥界、采矿冶金、矿物分析等行业的物相分析工业标准。迄今为止，一些最大的晶体结构是用TOPAS求解出的。TOPAS 在国际粉末衍射结构协会international Structure Determination by Powder Diffractometry Round Robin 2中的表现最佳。

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