α-变形菌

变形菌门下的一纲

α-变形菌（Alphaproteobacteria）是变形菌门（Proteobacteria）下的一个纲[3]。此纲的成员变异性极大，且共通点极少，但他们确实系出同源。α-变形菌大多都是革兰氏阴性菌，而有些胞内寄生的物种缺少肽聚糖，而造成革兰氏染色变异。

特性

α-变形菌包含多种细菌，其中包含光自营细菌、植物共生菌（如根瘤菌）、内共生细菌（如Wolbachia），和胞内寄生细菌（如立克次体）。

此外，本纲还包含已灭绝的Proto-mitochondrion。真核生物的祖先摄入了此种细菌，进行内共生作用，成为后来的线粒体。还有一种生物技术上很喜欢使用的农杆菌（Rhizobium radiobacter）也是本纲成员，科学家常常使用本物种来将外来DNA导入植物基因体中。另外，一些光自营生物像是遍在远洋杆菌（Pelagibacter ubique）也属于此纲，α-变形菌的微生物可能占了海洋微生物的10%左右。

演化及基因体

关于本纲所属的目，有人反对现行的分类法，尤其是Pelagibacterales的地位，但大体上大家还是普遍接受。细菌的分类学一直是分类学家相当头痛的问题，因为细菌的基因会彼此互相交流，且基因歧异度相当高（像是遍在远洋杆菌由于他的寄生行为，就会精简化他的基因体）。在某些目中，其成员的GC含量变异也大的夸张。举个例子，像是Pelagibacterales、立克次体目（Rickettsiales）和Holosporales三者的基因体都含有高AT含量，有人认为那其实是趋同演化所导致的假象，而反对方也有他们自己的论述。后来有人发现用以判断分类依据的rRNA中，GC含量好像不太会受基因体变异影响。因此，rRNA中GC含量较高的Holosporales就被和低GC含量的Pelagibacterales和立克次体目分开了。

α-变形菌纲下有三个亚纲Magnetococcidae、立克次体亚纲（Rickettsidae）和柄杆菌亚纲（Caulobacteridae）。基群为Magnetococcidae，此类别包含了许多趋磁细菌（由于趋磁细菌为多系群，因此只有部分包含于α-变形菌之下）立克次体亚纲则由细胞内寄生的立克次体目（Rickettsiales），以及可以在胞外单独生存的Pelagibacterales。柄杆菌亚纲则由Holosporales、红螺旋菌目（Rhodospirillales）、鞘脂单胞菌目（Sphingomonadales）、红细菌目（Rhodobacterales）、柄杆菌目（Caulobacterales）、Kiloniellales、Kordiimonadales、短小盒菌目（Parvularculales），和Sneathiellales。

参考文献

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