南通市通州区水利局是经南通市通州区机构改革优化设置的新部门，为南通市通州区人民政府工作部门。
主要职责
一、贯彻执行党和国家有关水利方面的方针政策、法律法规以及省市区决策部署并监督实施。拟订全区水利政策措施并监督实施。
二、负责保障水资源的合理开发利用。组织编制全区区域水利综合规划和水资源规划、防洪规划、水土保持规划等水利规划。编制全区水域及其岸线利用、主要河道治理等专业（项）规划。对有关国民经济和社会发展规划、城乡总体规划提出意见建议，按规定组织开展重大建设项目的水资源、防洪、水土保持论证评价工作。
三、负责生活、生产经营和生态环境用水的统筹和保障。组织实施最严格水资源管理制度，实施水资源的统一监督管理，拟订全区水中长期供求规划、水量分配方案并监督实施。负责重点水利工程的水资源调度。组织实施取水（含矿泉水、地热水）许可、水资源论证制度，组织开展水资源有偿使用工作。指导水利行业供水、排水和再生水利用工作。
四、负责水资源保护工作。组织编制并实施水资源保护规划。指导饮用水水源保护有关工作，按规定组织饮用水源地设置论证工作。组织指导地下水开发利用和地下水资源管理保护。组织指导地下水超采区综合治理。按规定组织开展水资源承载能力监测预警工作。
五、负责节约用水工作。拟订节约用水政策，组织编制节约用水规划、拟订行业用水标准并监督实施。组织实施用水总量控制等管理制度，指导和推动全区节水型社会建设工作。
六、负责水利固定资产投资计划和资金监督管理工作。负责区级水利建设资金的计划、使用、管理及内部审计监督。研究提出有关水利的价格、收费、信贷、财务等方面的建议。
七、组织实施重点水利工程建设和质量与安全监督。组织指导水利基础网络建设，组织指导水利建设市场的监督管理。编制、审查水利基本建设项目建议书和可行性报告。负责全区水利工程建设质量与安全监督工作。依法负责水利行业安全生产工作。
八、组织指导河道水域及其岸线的管理、保护与综合利用。组织指导等级骨干河道的治理、开发和保护，组织实施河道水生态保护与修复、河道生态流量水量管理以及河道水系连通工作。
九、组织指导水利设施的管理与保护。组织编制水利工程运行调度规程，负责泵站、堤防、水闸等区属水利工程的运行管理与确权划界。
十、指导农村水利工作。指导灌排工程建设与改造。指导农村饮水安全、镇（区、园、街道）供排水等工程建设与管理工作，指导节水灌溉有关工作；指导农村水利社会化服务体系建设；组织开展农村河道疏浚整治工作；负责基层水利服务体系建设；负责全区水土流失综合防治工作；指导农村水利改革创新。牵头负责农村水环境治理工作。
十一、组织指导水土保持工作。组织编制水土保持规划并监督实施，负责水土流失综合防治、监测预报并定期公告。负责生产建设项目水土保持监督管理工作。负责区重点水土保持建设项目的实施。
十二、负责水旱灾害防御及水量调度工作。组织编制洪涝干旱灾害防治规划和防护标准并指导实施。承担水情旱情监测研判预警工作。组织编制主要河道和重要水工程的防御洪水抗御旱灾调度及应急水量调度方案，按程序报批并组织实施。承担防御洪水应急抢险的技术支撑工作。承担台风防御期间重要水工程调度工作。
十三、指导三峡移民管理工作。贯彻落实三峡移民有关政策，指导监督三峡移民后期扶持政策实施。
十四、组织水利科学技术研究和推广。组织指导全区水利行业技术标准、规程规范的实施。组织指导水利信息化和水利行业对外技术合作与交流工作。
十五、负责涉水违法事件的查处，受区政府委托，协调部门之间和镇（区、园、街道） 之间的水事纠纷。组织水利行政许可、水政监察、水行政执法和普法宣传工作。负责全区河道采砂的统一管理和监督检查。
十六、承担区河长制工作领导小组办公室的日常工作。
十七、完成区委、区政府交办的其他任务。
十八、职能转变。加强水资源的合理利用、优化配置和节约保护。坚持节水优先，从增加供给转向更加重视需求管理，严格控制用水总量和提高用水效率。坚持统筹兼顾，保障合理用水需 求和水资源的可持续利用。加强水域和水利工程 的管理保护，加强长江通州段水域及其岸线管理与保护工作。
内设机构
一、办公室(人事科)。负责机关日常运转，承担信息、宣传、安全、保密、信访、政务公开等工作；负责机关及所属事业单位的干部人事、机构编制、劳动工资、教育培训、机关绩效管理等工作。负责全区水利系统人才工作和职工队伍建设；负责机关及所属事业单位离退休干部工作。
二、规划建设科（工程管理科、质量安全监督科）。拟订全区水利发展规划，组织编制区域水利综合规划、专业规划及年度水利计划规划并监督实施，拟订区级水利投资计划；组织指导有关防洪影响论证工作；按规定编制、审查大中型水利建设项目建议书、可行性研究报告；组织实施省下达的水利基本建设项目投资计划，承担水利统计工作；指导全区水利基本建设管理工作，负责区重点水利工程建设项目法人及招投标活动的监督管理；负责区重点水利工程建设的验收；指导水利建设市场的监督管理和水利建设市场信用体系建设；督促检查水利重大政策、决策部署和重要工作的贯彻落实情况；承担防御洪水应急抢险的技术支撑工作；承担防汛防台期间水利工程调度工作；组织指导全区水利设施的管理、保护和综合利用；组织编制水利工程运行调度规程，负责泵站、堤防、水闸等区属水利工程的运行管理与确权划界；组织实施引江调水工作；负责全区水域及其岸线的管理和保护，负责区域主要河道的开发、治理和保护；组织实施河道水生态保护与修复以及河道水系连通工作；会同相关部门指导全区河道保护规划编制工作；负责河道采砂规划和计划的编制并监督实施；承担区河长制工作领导小组办公室的日常工作；组织拟订推行河长制工作制度，编制工作计划和考核目标；向区级河长提出工作建议，落实区级河长确定的事项；对河长制工作落实情况进行检查、督察、考核；协调河长制工作重点事项和问题。组织实施水利工程质量和安全监督；承担水利行业安全生产监督管理工作；组织或参与制定水利行业安全管理规程规范；负责区属水利工程管理单位、重点建设项目的安全监管；组织重大水利安全生产事故的调查处理。
三、水政水资源科（行政服务科、三峡移民科）。按规定负责规范性文件的合法性审查、备案并监督实施；组织开展有关水利改革与发展的研究；指导法治水利建设和依法行政工作；指导行政执法工作；承办局行政复议、行政诉讼和行政赔偿工作；负责水利系统法治宣传教育和普法宣传工作；负责洪水影响评价类、取水许可及生产建设项目水土保持方案、河道采砂及管理范围内从事有关活动、水利项目设计文件审查等行政审批工作，并限时办结；指导三峡移民管理工作；贯彻落实三峡移民管理有关政策实施，指导监督三峡移民后期扶持政策实施；承担实施最严格水资源管理制度相关工作，负责开展水资源有偿使用工作；负责水量分配工作并监督实施，组织指导河道生态流量水量管理；组织编制水资源保护规划，指导饮用水水源保护有关工作，按规定组织饮用水源地设置论证工作；负责地下水开发利用和地下水资源管理和保护，组织指导地下水超采区综合治理；指导雨洪资源利用的工程建设与管理；拟订节约用水政策，组织编制并协调实施节约用水规划，拟订行业用水标准并监督实施；组织指导计划用水、节约用水工作；组织实施用水总量、用水效率控制和定额管理制度；指导全区节水型社会建设工作；会同相关部门指导农业节水工作；指导城市污水处理回用等非常规水源开发利用工作。
四、财务审计科。负责水利系统财务会计和内部审计工作；负责编制区级水利部门预算并监督执行；负责区级水利资金的使用及监督管理；指导区级水利国有资产的监督管理工作；提出有关水利价格、收费、信贷的建议；负责所属单位财务管理、内部审计工作，协助做好领导干部的任期经济责任审计工作。
五、农村水利与水土保持科（水利科技科）。指导灌排工程建设与改造；指导农村饮水安全、镇（区、园、街道） 供排水等工程建设管理工作，指导节水灌溉有关工作；指导农村水利社会化服务体系建设，组织开展农村河道疏浚整治工作；负责基层水利服务体系建设；负责全区水土流失综合防治工作；组织编制水土保持规划并监督实施；负责农业水价综合改革工作；负责水土流失监测、预报并定期公告；组织编制水利科技、水利信息化发展规划；负责水利科技项目和科技成果管理工作，组织水利科学技术研究、技术引进和技术推广；组织实施水利行业技术标准、规程规范；负责水利科技和水利信息化工作；负责水利行业对外技术合作与交流工作。
机关党总支。负责机关及所属事业单位的党建工作。
现任领导
局长：陈晓飞
所获荣誉
2020年2月6日，被江苏省人力资源和社会保障、
江苏省水利厅授予“江苏省水利系统先进集体”称号。