哈工大是我国较早建立经济管理类专业的院校，20世纪20年代就通过院校合并建立了商科，20世纪30至40年代先后建立了商业运输系、运输经济系、东方经济系等专业。20世纪50年代初通过苏联专家的帮助，为全国高等工科院校开展工程经济教育进行示范教学；1954年建立了“机器制造企业经济、组织与计划”和“动力企业经济、组织与计划”两个专业；1955年成立了“工程经济系”，是我国高等工科院校中第一个建立工程经济方面的科系。工程经济系在培养本科生和研究生的同时，还受教育部和有关部委的委托，为全国高等院校培养了大批管理专业师资，为有关部委培养了大批管理干部，使哈工大成为我国工程经济教育的摇篮，为我国管理教育的普及与发展作出了重要贡献。1978年改名为“管理工程系”。1984年8月，经国家教育部批准，成立了“哈尔滨工业大学管理学院”，是我国首批建立的管理学院之一，1986年获得“管理工程”专业博士学位授予权。哈尔滨建筑大学1980年设立了“建筑管理工程”专业，并组建了“建筑管理工程系”，是我国首批开展建筑管理工程本科教育和建筑经济及管理专业硕士生培养的院校之一，1993年成为我国唯一的建筑经济及管理博士学位授权单位，1999年成立哈尔滨建筑大学管理学院。2000年6月原哈尔滨工业大学与原哈尔滨建筑大学合校，两校的管理学院合并，组成了新的“哈尔滨工业大学管理学院”。2008年3月国际经贸关系学院与管理学院合并组成经济与管理学院。2012年成为东北地区第一家通过AMBA国际商学院认证的学院，2017年先后通过中国高质量MBA教育认证（CAMEA）及AMBA国际商学院再认证。2021年顺利通过AACSB认证。
在60多年的发展历程中，学院在巩固原有优势的基础上，应对我国及世界变化的复杂环境，积极探索、发现管理领域新兴的研究问题及方向，在推动我国管理理论与实践的发展与创新上做了大量的工作，提出若干新的管理理论、方法与技术，使得若干研究领域或保持或达到国内领先水平，在国际上产生一定影响。
学院采取人才引进、自主培养和人才共享相结合的模式，通过有计划地引进海外人才和国内著名大学优秀博士；支持教师海外进修，提高国际学术交流能力；聘请海外知名学者担任兼职教授和兼职导师，建立首席学术顾问制度和海外学术院长制度，设立创新人才建设项目，培养国际知名的学术带头人，建设起一支结构合理的高水平人才队伍。
哈工大是中国较早建立经济管理类专业的院校，20世纪40年代就建立了“铁路管理、工程经济、东方经济”等专业。20世纪50年代初通过前苏联专家的帮助，为全国等工科院校开展工程经济教育进行示范教学；1954年建立了“机械制造企业经济、组织与计划”和“动力企业经济、组织与计划”两个专业；1986年获得“管理工程”
专业博士学位授予权。1999年成立哈尔滨建筑大学管理学院。2000年6月组成了新的“哈尔滨工业大学管理学院”。
学院采取人才引进、自主培养和人才共享相结合的模式，通过有计划地引进海外人才和国内著名大学优秀博士；支持教师海外进修，提高国际学术交流能力；聘请海外知名学者担任兼职教授和兼职导师，建立国际化学术顾问制度和学术伙伴制度，设立创新人才建设项目，培养国际知名的学术带头人，建设起一支结构合理的高水平人才队伍。截止2009年12月，学院有教师140人，其中教授37人（含博士生导师30人），副教授72人，教师博士化率62%以上。
学院继承和发扬哈工大“规格严格、功夫到家”的光荣传统，在科学研究和学生培养中形成了比较完善的科研体系和教学体系，为国家培养了大量各层次、各种规格的高级管理人才。其中有的成为全国知名的管理学院、院士和学科带头人。截至2009年12月，在校学生共计3473人，其中：本科生998人，硕士生593人，
博士生385人，在站博士后76人，高级管理人员工商管理硕士（EMBA）195人，工商管理硕士（MBA）570人，公共管理硕士（MPA）299人，工程硕士339人，外国留学生18人。
1952年通过前苏联专家的帮助，在全校各技术专业开设了《机械制造企业经济、组织与计划》课程，并为全国高等工科院校开展工程经济教育进行示范教学；1954年建立了“机械制造企业经济、组织与计划”和“动力企业经济、组织与计划”两个专业；1955年成立了“工程经济系”，是中国高等工科院校中第一个建立工程经济方面的科系。工程经济系在培养本科生和研究生的同时，还受教育部和有关部委的委托，举办了多期师资班和干部班，为全国高等院校培养了大批管理专业师资，为有关部委培养了大批管理干部，使哈工大成为中国工程经济教育的摇篮，为中国管理教育的普及与发展做出了重要贡献。1978年改名为“管理工程系”。1984年8月，经国家教育部批准，成立了“哈尔滨工业大学管理学院”，是中国首批建立的4所管理学院之一，1986年获得
管理工程专业博士学位授予权。
哈尔滨建筑大学1980年设立了“建筑管理工程”专业，并组建了“建筑管理工程系”，是中国首批开展建筑管理工程本科教育和建筑经济及管理专业硕士生培养的院校之一，1993年成为中国唯一的建筑经济及管理博士学位授权单位，1999年在建筑管理工程系的基础上成立了管理学院。2000年6月原哈尔滨工业大学与原哈尔滨建筑大学合校，两校的管理学院合并，组成了新的“哈尔滨工业大学管理学院”。 管理学院设有
管理科学与工程、技术经济及管理、企业管理三个博士学位授予点和管理科学与工程
博士后流动站，其中管理科学与工程学科（一级学科）是国家重点学科， 2002年在全国一级学科综合水平评估中排名第三。学院设有管理科学与工程、企业管理、技术经济及管理、会计学、行政管理、国际贸易学、
土地资源管理、教育经济与管理、金融学等九个硕士学位授予点，是中国培养工商管理硕士（MBA）、
高级管理人员工商管理硕士（EMBA）和公共管理硕士（MPA）的首批试点院校之一，并设有工程项目管理、工业工程、物流工程三个工程硕士专业学位授予点。学院下设管理科学与工程系、营造与房地产系、工商管理系、金融与贸易系、会计系、公共管理系，分别设有信息管理与信息系统、工程管理、工商管理、市场营销、旅游管理、金融学、
国际经济与贸易、会计学、财务管理、电子商务等十个本科专业。设有管理科学研究所、信息管理与信息系统研究所、
系统工程研究所、技术经济及管理研究中心、交通工程研究中心等十四个研究所与研究中心；设有三个编辑部，正式出版全国发行的综合性学术刊物《管理科学》（原名为《决策借鉴》）、《
公共管理学报》和《建筑管理现代化》。
管理学院继承和发扬了哈工大“规格严格、功夫到家”的光荣传统，在研究生和本科生的培养中形成了比较完善的教学体系，具有多学科培养高级管理人才的基础与条件；在学科建设上已形成了信息管理与信息系统、组织理论与组织创新、国际制造战略、先进制造技术管理、系统工程理论与方法、国防经济与管理、建筑经济与管理、建筑业管理的信息化与国际化、管理评价理论与方法、金融工程、投资理论、技术经济分析原理和方法、技术创新理论与政策、市场营销理论与实践、会计理论与实践、财务管理理论等研究方向。多年来，为国家培养了大量各层次、各种规格的高级管理人才和高等院校管理专业师资，其中有的在国家部委、省、市的领导岗位上任职，有的成为国内知名的企业家，有的成为全国知名的管理学家、院士和学科带头人。
科学研究是学院建设和发展的重要组成部分。学院注意结合自身的特点，强调管理理论与管理实践相结合，为国家的经济建设服务、为工厂企业服务。学院现今共承担
国家自然科学基金和社会科学基金、国家攻关计划、863计划等国家级项目近20项，省部委项目、企业委托的科研课题近300项，发表学术论文千余篇，出版学术专著和教材近百本。其中“中国高技术企业技术创新研究”、“中国区域持续发展系统分析评价方法研究”、“管理的评价理论与方法”、“建设领域信息化标准体系研究”、“城市数字化工程发展战略与政策研究”、“住宅产业发展研究”、“小城镇建设”、“航天技术与可持续发展研究”、“企业动态联盟组织、环境运营模式优化方法”、“企业资产重组与技术创新研究”、“国防高技术战略管理研究”、“高技术风险投资市场培育研究”等项目，“城市建设信息管理系统研究与示范工程”、“一汽集团零部件成本核算控制系统设计”、“黑龙江省国有大中型企业开展资本运营策略研究”、“黑龙江省邮电管理局劳资管理信息系统”、“国家乳业工程技术研究中心计算机管理信息系统”、“广州市交通管理发展规划”、“中国静态交通设施建设融资问题研究”等一系列课题，密切结合政府、企业在社会经济发展和管理决策方面的需要，针对政府和企业从计划经济向市场经济转变过程中面临的重大管理问题进行研究，为政府宏观决策和企业集团的发展在管理理论和现代管理方法上提供了咨询和服务。