方柏山

福建省微生物学会常务理事

方柏山, 男，福建莆田人，1957年生于北京，工学博士，闽江学者特聘教授，博士生导师。现任厦门大学化学化工学院化学工程与生物工程系生物化工研究所所长。

人物经历

学历

1978.03-1982.01

浙江大学化学工程专业，获学士学位

1996.09-2000.06

天津大学化学工程专业，获博士学位

留学

1991.10-1993.04

德国斯图加特大学生化工程研究所访问（DAAD奖学金资助）

2000.08-2001.08

德国生物技术研究中心（GBF）访问

职称

1983.02-1988.07

华侨大学化工与生化工程系生化工程教研室，助教

1988.07-1994.06

华侨大学化工与生化工程系生化工程教研室，讲师

1994.06-1998.07

副教授（1995年起被聘为硕士生导师）

1998.07-今

教授（破格晋升，2003年起被聘为天津大学生物化工合作博导、2004年起被聘为华侨大学生物化工博士生导师）

职务

1984.09-1990.07

华侨大学化工与生化工程系科研秘书和实验室秘书（兼）

1993.04-1995.03

华侨大学化工与生化工程系生化工程教研室副主任、主任

1995.03-1998.06

华侨大学化工与生化工程系副系主任（主持工作）

1998.06-1999.06

华侨大学化工学院常务副院长

1999.06-2000.08

华侨大学化工学院常务副院长（主持工作）

2000.08-2001.05

华侨大学化工学院常务副院长（出国）

2002.03-2008.08

华侨大学材料科学与工程学院院长、工业生物技术研究所所长、生物化工福建省重点学科学科带头人（2005-）、工业生物技术福建省高校重点实验室主任（2006-）

2008.09- 今

闽江学者特聘教授，厦门大学化学化工学院化学工程与生物工程系生物化工研究所所长

兼任中国微生物学会生化过程模型化与控制专业委员会常务理事、中国生化与分子生物学学会工业生化与分子生物学分会理事、福建省化工学会副理事长、福建省生化与分子生物学学会副理事长、福建省微生物学会常务理事。

主讲课程

本科：计算机在生物工程中的应用、酶工程、生物反应工程。

硕士研究生：生物反应工程、酶工程、生物信息学、生化过程模型化与控制。

博士研究生：生物化工研究进展、代谢工程等。

主要贡献

参加国家重点基础研究发展计划（973计划）1项（生物炼制细胞工厂的科学基础）、负责国家高技术研究发展计划（863计划）项目：“生物基化学品的生物炼制技术”子课题2项、主持国家自然科学基金资助项目4项（“甘油酶法连续歧化及其产物分批提纯的过程集成”；“胞外甘油酶法歧化与其产物分离提取的过程集成”；“1，3-丙二醇生产菌的定向酶进化及其关键酶的构效关系”；“基于荷电膜、辅酶再生的多酶连续催化过程研究”）、福建省自然科学重点项目基金资助项目2项、福建省重点科技基金资助项目1项、国家教委留学回国人员基金资助项目1项、福建省自然科学基金资助项目2项和福建省教育厅优秀留学回国人员基金资助项目1项。出版著作1部（生物技术过程模型化与控制）、参编著作1部（微生物工程）、发表学术论文90多篇。

科研

参加国家重点基础研究发展计划（973计划）：生物炼制细胞工厂的科学基础-代谢功能的环境应答和适应机制（2007CB707804，2007.1-2011.12）

负责国家高技术研究发展计划（863计划）项目：“生物基化学品的生物炼制技术”子课题“代谢途径中关键酶酶学性质研究” （2006AA020103，2006.12-2010.12）

3 负责国家高技术研究发展计划（863计划）项目：“生物基化学品的生物炼制技术”子课题“L- 乳酸高产菌株选育” （2006AA020102，2006.12-2010.12）

主持国家自然科学基金资助项目：甘油酶法连续歧化及其产物分批提纯的过程集成（20676048，2007.1-2009.12）

主持国家自然科学基金资助项目：胞外甘油酶法歧化与其产物分离提取的过程集成（20446004，2005.1-2005.12）

主持国家自然科学基金资助项目：1，3-丙二醇生产菌的定向酶进化及其关键酶的构效关系（20276026，2003.1-2005.12）

主持国家自然科学基金资助项目：基于荷电膜、辅酶再生的多酶连续催化过程研究（29776025,1998.1-2000.12）（注：有关木糖生物转化生产木糖醇方面的研究）

主持国家教委留学回国人员基金资助项目：应用神经网络于木糖醇发酵过程研究（1994-1996）

主持福建省自然科学重点项目基金：用辅酶再生多酶催化法连续生产1，3-丙二醇和二羟基丙酮（D01012，2001.5-2004.5）

主持福建省自然科学重点项目基金资助项目：木糖醇发酵与产物提纯过程研究（C96068，1996.5-1999.5）

主持福建省科技重点项目基金资助项目：应用DNA家族重排技术开发1,3-丙二醇生物法生产新菌株（2003I020，2003.5-2006.4）

参加福建省科技重大专项：制革行业清洁生产和循环经济技术的研发（2005HZ03-3，2005.7-2008.6）

主持福建省自然科学基金资助项目：发酵产品生产过程调优研究（1989-1991）

主持福建省自然科学基金资助项目：木糖醇生产菌的选育（1994.5-1996.5）

主持福建省自然科学基金资助项目：基于荷电膜、辅酶再生的多酶连续催化过程研究（F99021，1999.5-2001.5）

主持福建省自然科学基金资助项目：1,3-丙二醇生产菌的定向酶进化及其关键酶的构效关系研究（F0310020，2003.5-2006.5）

主持福建省教委优秀留学回国人员基金资助项目：生物微胶囊固定化酵母细胞的研究（1999-2000）（注：有关木糖生物转化生产木糖醇方面的研究）

主持广东新北江制药有限公司委托研究项目：妥布霉素发酵工艺条件调优（2000.5-2002.4）

为主参加福建省自然科学基金资助项目：无电荷超滤膜酶膜反应器中氧化还原酶催化过程研究（2005.5-2008.5）

为主参加福建省自然科学基金资助项目：发酵物提纯反应与分离耦合相平衡研究（B9810011，1998-2001）

为主参加生物反应器国家重点实验室项目：生物反应过程“软传感器”开发（1999-2001）（注：有关木糖醇发酵过程“软传感器”开发）

著作

方柏山著，《生物技术过程模型化与控制》，暨南大学出版社，1997.12

张嗣良，方柏山，《生物反应过程检测与控制》，化学工业出版社（待出版）

吴松刚主编，《微生物工程》，科学出版社，2004（参加编写部分章节）

专利

论文

方柏山，由分批培养数据估算微生物生长动力学和能学参数，生物工程学报，2⑷： 54-60,1986.

俞俊棠，张嗣良，方柏山，Retrospect of Practical and Engineering Problems in industry,Horizon in Biochemical Engineering,P306- 316,University of Tokyo Press,1987.

方柏山，林金清，A New method for the Parameter Estimation of Fermentation Kinetics,Presented at 2nd international Biotechnology Conference: Asian Pacific Biotechnology Conference,May 6-9,1990,Seoul,Korea (Eng).

方柏山，应用单纯形法于微生物生长动力学及能学参数的估算，Beijing International Conference on Biotechnology,July 8-10,1989,Beijing China. 生物工程学报，7⑶： 257-262,1991；Chinese Journal of Biotechnology,7⑶： 223-228,Allerton Press,Inc,New York （1991）.

方柏山，林金清，分批发酵动力学参数估算，生物工程学报，8⑶： 283- 287,1992 ； Chinese Journal of Biotechnology 8⑶： 203- 210,Allerton Press,Inc. New York （1991）.

Fang Baishan,The Application of Artificial Neural Network to the Process Predication of Penicillin Fermentation in Fed-Batch. 205 th ACS National Meeting,March 28- April 2,1993,Denver,Colorado,U.S.A.

方柏山，林金清，谷氨酸发酵最佳操作曲线的确定，华侨大学学报,15⑶：331 -334,1994.

方柏山，补料分批培养过程摸拟，生物工程学报，10⑶，1994 ；Chinese Journal of Biotechnology 10⑶，Allerton Press,Inc. New York （1994）.

Fang Baishan,Application uniform design in training of artificial neural networks,Proceedings of SCI'94,Systems,Control,Information Methodologies & Applications,Vol. Ⅱ，932-935,Huazhong University of Science and Technology Press,Wuhan,Hubei,China （1994）.

Fang Baishan,Artificial neural network for estimation of volumetric oxygen transfer coefficient,The 1st Global Conference of Young Chinese Biochemical Engineers,July 7-10,Dalian China （1996）.

方柏山，胡宗定，青霉素补料分批培养过程的神经网络模型，生物工程学报，12（增刊）：215-218,1996.

Fang Baishan and Chen Hongwen,Parameter estimation of dynamic model in batch fermentation using genetic algorithms,Frontiers in Bioprocess Engineering,159-160,Tianjin University,Tianjin,China （1997）.

Fang Baishan,Artificial neural networks for pattern recognition of volumical gas-liquid mass transfer coefficient,Biochemical Engineering: Marching Toward the Century of Biotechnology,Vol. 2,1205-1208,Tsinghua University Press （1997）.

方柏山，S. Sirisansaneeyakul，木糖醇发酵过程状态估算、预测与优化，生物工程学报，1998 ， 14⑴： 81-86

方柏山，谢晓兰， S. Sirisansaneeyakul ，胡宗定，木糖醇发酵过程检测的 “ 软传感器 ” 开发，天津大学学报，⑸： 2000.

Fang Baishan,et al,Process optimization of Xylitol fermentation in Candida mogii,5 th Asia- Pacific Biochemical Engineering Conference,Dec. 13–15 ，1999,Thanland.

方柏山，陈宏文，胡宗定，基于遗传算法的木糖醇发酵培养基配方优化的研究，第五届全国生化过程模型化与控制会议，杭州， 1999 年12 月。化学反应工程与工艺， ⑵： 2000.

方柏山，陈宏文，谢晓兰，万宁，胡宗定等，基于遗传算法和神经网络的木糖醇发酵培养基配方优化的研究，生物工程学报，2000，16⑸：648-650

Fang Baishan,H. Chen,X. Xie,N. Wan,Y. Mei,Study on xylitol production using genetic algorithms coupling neural networks：Ⅰ. Medium optimization,Process Biochemistry,38⑺：979-985,2003

方柏山，郑媛媛 . 酶体外定向进化：1. 突变基因文库构建技术及其新进展，华侨大学学报， 2004,25⑷：337-342

方柏山，洪燕，夏启容. 酶体外定向进化：2. 文库筛选的方法及其应用，华侨大学学报，2005，26⑵：113-116

Fang Baishan,Chen Hongwen,Xie Xiaolan,Zhang Weiwei,Wan Ning,Hu Zongding. Model and optimization for xylitol fermentation and purification process,The World Congress on Biotechnology,3-8,Sept. Berlin,2000.

Chen Hongwen,Fang Baishan,Hu Zongding. Optimization of process parameters for k ey enzymes accumulation of 1,3-propanediol production from Klebsiella pneumonia,Biochemical Engineering Journal,2005，25：47-53

陈宏文，方柏山等. 木糖醇发酵动力学研究，无锡轻工大学学报，2002.21⑹： 579-582

陈宏文，金福江，方柏山. 发酵过程中细胞浓度在线检测系统，微生物学通报，2003 ，30⑶：39-43

陈宏文，王蔚，方柏山，胡宗定 . 克雷伯杆菌生产1,3- 丙二醇关键酶发酵条件研究，高校化学工程学报， 2004,18⑸：621-627

陈宏文，许传鹏，张媛，方柏山，胡宗定 . 莫格假丝酵母微胶囊化生产木糖醇的研究，食品科学， 2004,25⑼：92-95

陈宏文，王蔚，方柏山，胡宗定. 克雷伯杆菌生产 1,3- 丙二醇关键酶酶活分析方法研究，广州食品工业科技， 2004 ， 20⑶：5-9

陈宏文，洪其文，徐晶，方柏山，胡宗定 . 克雷伯杆菌利用甘油有氧发酵生产 3- 羟基丙醛的研究，现代化工， 2004,24⑾：36-39

陈宏文，陈瑜丽，兰凤英，方柏山，胡宗定 . 克雷伯杆菌微胶囊化生产 1,3- 丙二醇的研究，现代化工， 2004,24（增刊）：138-140

陈宏文，吴雅红，吴振华，方柏山，胡宗定 . 克雷伯杆菌甘油脱氢酶的分离纯化及其性质研究，无锡轻工大学学报，2005，⑵

谢晓兰，方柏山，应用人工神经网络于木糖醇发酵液脱色过程研究，无锡轻工业学院学报， ⑹： 2000.

万宁，方柏山，李维成，苏志国. 细胞粗提液中木糖还原酶的催化特性及其影响因素，华侨大学学报，2001 ，22⑵： 194-198

梅余霞，谢晓兰，万宁，方柏山. 木糖醇发酵液脱色的优化工艺，华侨大学学报， 2000 ， 21⑷： 394-398

Zheng Yuanyuan,Cao Yang and Fang Baishan*.Cloning and sequence analysis of the dhaT gene of the 1,3-propanediol regulon from Klebsiella pneumoniae. Biotechnology Letters. 26:251-255（2004）

Cao Yang,Zheng Yuanyuan,Fang Baishan. Optimization of polymerase chain reaction-amplified conditions using the uniform design method . Journal of Chemical Technology and Biotechnology,2004,79:910-913

Cao Y,Xia QR& Fang BS. Optimization of expression conditions of dha T from Klebsiella pneumoniae in Escherichia coli using the methods of uniform design and regression analysis.Journal of Chemical Technology Biotechnology，2006，81，109－112

曹阳. （2005）多序列比对程序及使用技巧 . 生物学通报 40 ⑴： 11-12.

曹阳，郑媛媛，方柏山. （2004）用生物信息学软件分析风信子 HPI1 基因及其产物蛋白. 生物信息学 2 ⑷： 25-29.

Zhang GY,Fang BS,Discrimination of thermophilic and mesophilic proteins via pattern recognition methods,Process biochemistry,2006，441：552-556.

Zhang GY,Fang BS,A uniform design based support vector machine model for predicting optimum temperature in G/11 xylanase,Process biochemistry,Accepted,in revision.

Zhang GY,Fang BS,Application of amino acid distribution along the sequence for discriminating mesophilic and thermophilic proteins. Process biochemistry,2006,41：1792-1798.

Zhang GY,Fang BS,Support vector machine for discrimination of thermophilic and mesophilic proteins based on amino acid composition,Protein & Peptide Letters,2006,13⑽，965-970.

Zhang GY,Fang BS,LogitBoost classifier for discriminating thermophilic and mesophilic proteins，Journal of biotechnology. Accepted,available online.

Zhang GY,Fang BS,A uniform design based BP-neural network model for amino acid composition and optimum pH in G/11 xylanase,Journal of chemical technology and biotechnology,2006，81 ⑺： 1185-1189.

Zhang GY,Fang BS,The influence of dipeptide composition on optimum temperature of alcohol dehydrogenase. Enzyme and Microbial Technology,2006,39：811-816.

张光亚，方柏山，嗜热和常温蛋白模式识别的研究，生物工程学报，2005,21⑹：960-964.

张光亚，方柏山，基于二肽组成识别嗜热和常温蛋白的研究，生物工程学报，2006,22⑵： 293-298.

张光亚，方柏山，木聚糖酶氨基酸组成与其最适pH的神经网络模型，生物工程学报，2005,21⑷： 658-661.

张光亚，方柏山，基于Boosting机制的决策树集成分类器识别嗜热和常温蛋白，生物工程学报，2006，22⑹：1026-1031.

张光亚，方柏山，主成分分析的神经网络及其在G/11家族木聚糖酶最适pH建模中的应用，计算机与应用化学，2005,22⑼：749-752.

张光亚，刘桂兰，方柏山，基于支持向量机识别嗜热和常温蛋白的研究，计算机与应用化学，2006,23⑻：707-710.

张光亚，李猛，方柏山，乙醇脱氢酶氨基酸组成和最适温度均匀设计的神经网络模型，计算机与应用化学，2006,23⑽：

张光亚，方柏山，宏基因组——生物催化剂的新来源，生命的化学，2005,25⑷： 278-281.

张光亚，方柏山，生物催化剂的发现及改造，生命的化学，2006,26⑶： 258-261.

张光亚，郑兰香，方柏山，BYSJ软件的设计及其在生物信息中的应用，华侨大学学报，2006，27⑴：105-107.

张光亚，方柏山，木聚糖酶氨基酸组成与最适温度的模型，华侨大学学报，2005,26⑵： 191-194.

张光亚，方柏山，两种超嗜热菌基因组中同义密码子使用的分析，华侨大学学报，2006,27⑵：193-196.

张光亚，方柏山，闵航，好氧同时硝化－反硝化菌的分离鉴定及系统发育分析，应用与环境生物学报，2005,11⑵：226-228.

彭益强，方柏山. 酶膜反应器及其在工业应用中的最新进展，化工时刊，2004,18⑴：13-17

彭益强，方柏山等.植酸酶的激光诱变改性与分离纯化. 精细化工，2005，22⑻：586-588

彭益强，方柏山. 甲克素脱乙酰酶作用机理及基因克隆表达研究进展. 中国医工业杂志2005，36⑾：716-719

彭益强，方柏山.中性植酸酶放菌的激光复合诱变筛选，激光生物学报，2006,15⑵：195-197

彭益强，方柏山等.膜反应器中辅酶再生体系的构建与研究进展. 化工进展，2006，⑶：264-270

彭益强，方柏山. 激光诱变在热稳定植酸酶筛选中的应用，激光生物学报，2006,15⑷：405-409

彭益强，方柏山等.可溶性低聚壳聚糖的制备与抗菌性能研究，食品科学，2007（已录）

李夏兰，魏国栋等. 均匀设计法优化芥菜多糖提取工艺的研究. 食品与发酵工业，2005,31⑻：104-106.

魏国栋，李夏兰，王昭晶，方柏山. 均匀设计法优化芥菜多糖的提取工艺及其神经网络模型的研究. 食品与发酵工业，2006,32⑵：53-56.

李夏兰，魏国栋等. 包心芥菜多糖的微波辅助提取及其醇沉工艺的研究. 食品工业科技，2006,27⑸：123-125

李夏兰，魏国栋等. 芥菜茎中水溶性多糖的分离纯化及性质初步研究. 福建师范大学学报，2006,22⑵：72-75.

罗巅辉，方柏山. 酶定向进化的研究进展. 生物加工过程，2006,4⑴：，9-15

夏启容，方柏山，洪燕. 酶体外定向进化：3. 展示技术及其应用，华侨大学学报，2005，26⑷：333-337

洪燕，李雯君，张燎原，夏启容，方柏山．甘油脱水酶和二醇脱水酶β亚基克隆及生物信息学分析．[J]生物技术，2006，16⑷：1－4．

洪燕，张燎原，李雯君，夏启容，方柏山．甘油脱水酶生物信息学分析．[J]生物信息学，（已录用）

张燎原，曹阳，夏启容，洪燕，方柏山. 来源于克雷伯氏菌的1,3-丙二醇氧化还原酶的同源建模.生物信息学2006,4⑶：102-104

刘飞，方柏山. 微生物产氢机理的研究进展. 工业微生物，2007,2.

刘飞，方柏山. 克雷伯杆菌利用生物柴油副产物甘油生产氢气和1,3-丙二醇的菌种选育和发酵条件的研究. 食品与发酵工业，2006,11: 1-4

Fei Liu,Baishan Fang. Cloning and sequence analysis of the gene encoding NiFe-hydrogenase from Klebsiella pneumoniae. Chinese Journal of Biotechnology,2007,1.

Fei Liu,Baishan Fang. Optimization of bio-hydrogen production from biodiesel wastes by Klebsiella pneumoniae，Biotech Journal，（in press）.

兰琳，林锡煌，彭益强，方柏山.耐高浓度甘油的1,3-丙二醇生产菌的诱变选育.华侨大学学报，已录用

林锦霞，张光亚，方柏山.1,3-丙二醇氧化还原酶结构与功能关系的探讨.[J]生物信息学，2005，⑶：101-103.

林锦霞，张燎原，张光亚，方柏山.计算机模拟短小芽孢杆菌木聚糖酶与底物木聚糖的对接.[J]生物工程学报，已录用

Li Wenjun，Fang Bashan，Hong Yan，Wang Xiaoxia，Lin Jinxia，Liu Guilan．Cloning and Expression of the Genes Encoding Glycerol Dehydratase Reactivase and Identification of its Biological Activity. CHINESE JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY，（已录用）

李雯君，方柏山，洪燕，王晓霞，林锦霞，刘桂兰.甘油脱水酶再激活酶的克隆表达及活性鉴定.[J]生物工程学报，2006,22⑹：950-955

刘英丽，李夏兰，余晓芬，方柏山．微波辅助酸水解麦糟制备低聚木糖的工艺[J]．华侨大学学报（已录用）。

余晓芬，刘英丽，李夏兰，方柏山．麦糟水解液中单糖及脂肪酸的高效液相色谱分析[J]．华侨大学学报（已录用）。

王晓霞，郑晨娜，王飞飞，方柏山. 共表达木聚糖酶和木糖还原酶生产木糖醇的研究.食品与发酵工业（已录用）

王晓霞，方柏山，李雯君. 乳糖诱导木糖还原酶基因在大肠杆菌中活性表达.华侨大学学报（已录用）

王晓霞，方柏山，罗菊香，李雯君，张燎原. Candida shehatae木糖还原酶的异源表达、纯化及酶学性质分析. 中国科技论文在线 2006,12

获奖记录

获国务院侨办科技进步三等奖1次（项目：生物反应过程模型化与优化）、福建省自然科学优秀论文二等奖4次、省科协优秀论文奖等4次。获“全国优秀教师”、“国务院侨办优秀教师”、“福建省高校优秀中青年骨干教师”、“华侨大学先进科技工作者” 、“华侨大学教学优秀特别奖”等称号。

《生物反应过程模型化与优化》获国务院侨办科技进步三等奖，负责人（1998.12）

福建省自然科学优秀论文二等奖四次（第一作者）

福建省科协优秀论文奖一次（第一作者）

全国优秀教师（2004.9）