杨琛

中国科学院上海生命科学研究院研究员

杨琛，女，博士，中国科学院上海生命科学研究院研究员。在国内外发表论文20余篇（包括J. Bacteriol., J. Biol. Chem., Appl. Environ. Microbiol., Biotechnol. Bioeng.等国际重要刊物）。

人物经历

1994年毕业于浙江大学化学工程系生物化学工程专业；

2001年获日本九州工业大学生物科学和生物信息学系博士学位；

2001至2004年日本庆应大学先端生命科学研究所博士后；

2004至2008年美国Burnham医学研究所博士后；

2008年入选中国科学院先进工业生物技术创新基地“百人计划”。

现任中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所研究员。

已在国内外发表论文50余篇（包括Mol. Microbiol., J. Biol. Chem., J. Bacteriol., PNAS等国际重要刊物）。

社会任职

上海市徐汇区第十五、十六、十七届人大代表。

研究工作

致力于开发代谢途径设计及网络调试平台，发展代谢流量组和代谢组分析技术、以及代谢途径和转录调控网络的比较基因组学重构技术等；研究重要模式及工业微生物代谢网络及其调控的分子机制，揭示各种调节机制的相互作用及对代谢流量的调控机理，为合理改造细胞代谢、优化微生物生产提供理论依据；并开展光合微生物的代谢工程与合成生物学研究，通过对结构元件和调控元件的功能优化及设计组装，实现目标化合物的优化生产。

人物荣誉

2019年8月2日，入选2019年度国家杰出青年科学基金建议资助项目申请人名单。

近期论文

1. Xiaoqun Nie,‡ Bin Yang,‡ Lei Zhang, Yang Gu, Sheng Yang, Weihong Jiang, Chen Yang*. (2016) PTS regulation domain-containing transcriptional activator CelR and sigma factor σ54 control cellobiose utilization in Clostridium acetobutylicum. Molecular Microbiology, in press.

2. Deng Liu and Chen Yang* (2014) The nitrogen-regulated response regulator NrrA controls cyanophycin synthesis and glycogen catabolism in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. Journal of Biological Chemistry 289: 2055-2071

3. Lei Zhang, Xiaoqun Nie, Dmitry Ravcheev, Dmitry Rodionov, Jia Sheng, Yang Gu, Sheng Yang, Weihong Jiang, Chen Yang* (2014) Redox-responsive repressor Rex modulates alcohol production and oxidative stress tolerance in Clostridium acetobutylicum. Journal of Bacteriology 196(22): 3949-3963

4. Dongfeng Liu, Guomin Ai, Qingxiang Zheng, Chang Liu, Chengying Jiang, Lixia Liu, Bo Zhang, Yiming Liu, Chen Yang*, Shuangjiang Liu* (2014) Metabolic flux responses to genetic modification for shikimic acid production by Bacillus subtilis strains. Microbial Cell Factory 13(1): 40

5. Yongzhen Tao, Deng Liu, Xing Yang, Zhihua Zhou, Jeong K. Lee, Chen Yang* (2012) Network identification and flux quantification of glucose metabolism in Rhodobacter sphaeroides under photoheterotrophic H2-producing conditions. Journal of Bacteriology 194(2): 274-283.

6. Lei Zhang, Semen A. Leyn, Yang Gu, Weihong Jiang, Dmitry A. Rodionov*, Chen Yang* (2012) Ribulokinase and transcriptional regulation of arabinose metabolism in Clostridium acetobutylicum. Journal of Bacteriology 194(5): 1055-1064.

7. Lixia Liu, Lei Zhang, Wei Tang, Yang Gu, Qiang Hua, Sheng Yang, Weihong Jiang, Chen Yang* (2012) Phosphoketolase pathway for xylose catabolism in Clostridium acetobutylicum revealed by 13C metabolic flux analysis. Journal of Bacteriology 194(19): 5413-5422.

8. Semen A. Leyn, Fang Gao, Chen Yang*, Dmitry A. Rodionov* (2012) N-Acetylgalactosamine utilization pathway and regulon in proteobacteria. Genomic reconstruction and experimental characterization in Shewanella. Journal of Biological Chemistry 287(33): 28047-56.

9. Yang Gu, Yi Ding, Cong Ren, Zhe Sun, Dmitry A. Rodionov, Weiwen Zhang, Sheng Yang, Chen Yang*, Weihong Jiang* (2010) Reconstruction of xylose utilization pathway and regulons in Firmicutes. BMC Genomics 11: 255.

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