持有特种金融债券的非银行金融机构申请进入回购市场，要先将其持有的特种金融债券交中央国债登记结算有限责任公司进行托管，开立特种金融债券托管帐户。
背景介绍
国债回购业务开展后，少数金融机构和交易场所在实际运行中违反中国人民银行、财政部、中国证券监督管理委员会（简称证监会）的有关规定，买空卖空国债，利率过高，期限过长，资金用途也不合理，扰乱了货币市场秩序。使大量已经到期的国债回购合同不能按期履约还款，出现了严重的资金拖欠，拖欠金额达数百亿元。
对此，中共中央和国务院予以高度重视，为此，中国人民银行、财政部、证监会于1995年8月8日联合下发了《关于重申对进一步规范证券回购业务有关问题的通知》（以下简称《通知》）。国务院还转发了《中国人民银行关于进一步做好证券回购债务清偿工作的请示》，根据《请示》要求，中国人民银行会同财政部、证监会联合成立了全国证券回购债务清欠办公室，指导、协调各地区。
各部门的证券回购债务清偿工作，并先后采取了一系列强有力的清欠措施。作为清偿的一项措施，国务院在国发[1996]20号文《国务院批转中国人民银行关于进一步做好证券回购债务清偿工作请示的通知》第三条规定“对于将回购资金用于长期投资，短期内无法收回，还债确有困难的金融机构，经中国人民银行批准，可适当发行一定数量的金融债券，用于偿还债务。”中国人民银行在银发[1996]244号《关于转发（国务院批转中国人民银行关于进一步做好证券回购债务清偿工作请示的通知）的通知》中对发行特种金融债券的机构、期限、利率等提出了具体的要求。
特点
在设计特种金融债券时
，中央银行采取了一系列防范风险的措施，规定：
1、发债机构仅限于将回购资金用于长期投资，短期内无法收回的金融机构；
2、发行对象仅限于机构，不得向个人发售；
3、发债资金必须专户存储，专款专用，优先用于清偿场内证券回购债务；
4、要求采用记账式发行方式，以防超冒发行和假券风险；
5、发行完毕后，发债机构和持券人必须到中央结算公司办理债券的托管手续，且发债机构必须以自有资产或担保人的资产进行抵押或质押，以担保债券本息的兑付，发债机构必须将资产抵（质）押手续都办妥后，才能进行债券的交易，中央结算公司可以根据抵（质）押资产的价值及状况变化要求发债机构对其抵（质）押资产进行调节；
6、特种金融债券用于回购时，回购融资额不得超过回购债券面值总额；
7、特种金融债券的交易只能在事先已在中央结算公司开立了结算户的非银行金融机构之间进行，银行只能卖出债券或只能从事正回购交易，非金融机构只能委托当地中国人民银行分行指定的非银行金融机构进行债券交易，个人不得参与债券交易；
特种金融债券
的交易原则上采取“钱券对付”的方式进行；
9、发债机构必须在中央结算公司选定的商业银行设立偿债基金专户，按距债券到期日的远近交纳不同比例的偿债基金；
10、发债机构必须定期公布其财务报告和资产评估报告，向投资人充分披露信息。以上这些措施，可以有效地防范特种金融债券的交易及兑付风险。与以前不规范的证券回购相比，主管机关在特种金融债券的发行及交易方面所采取的风险防范措施都要严厉得多。这些措施的采取，不仅适用于特种金融债券，而且对于其他券种及其衍生金融工具的发行与交易，都有一定的参考价值。
交易
非银行金融机构参与特种金融债券回购，其交易结算由中央国债登记结算有限责任公司统一办理。
中央国债登记结算有限责任公司要向对方出具“特种金融债券托管证明”。
持有特种金融债券的非金融机构可委托金融机构将其持有的特种金融债券用于回购。
全国统一的特种金融债券回购市场采用询价谈判、逐笔成交的方式进行。即交易双方经过协商，签订统一格式的“特种金融债券回购协议”，通过中央国债登记结算有限责任公司办理特种金融债券及资金的结算手续。
发行特种金融债券的非银行金融机构要向中央国债登记结算有限责任公司提交以下资料：
(一)中国人民银行批准该非银行金融机构发行特种金融债券的批文；
(二)《金融机构法人营业执照》；
(三)《金融机构法人许可证》；
(四)发债机构或担保单位的资产抵押证明。资产抵押证明必须经中国人民银行总行认定的会计师事务所审计，用于抵押的资产不得小于所发行的特种金融债券金额。发债机构要与中央国债登记结算有限责任公司签订资产抵押合同，规定所抵押的资产只能用于防范特种金融债券到期兑付风险，并按《中华人民共和国担保法》的有关规定办理抵押物登记等手续。
非发债非银行金融机构申请参与特种金融债券回购的，须提供以上(二)、(三)项资料。
特种金融债券回购期限分为五档：7天，20天，30天，60天，90天。
兑付
距特种金融债券兑付期前91天，发债机构要公告其债务偿还计划书，选择以下方式保证特种金融债券的按期兑付：以其持有的国债、政策性金融债券、中央银行融资券对其发行的特种金融债券进行置换；分期赎回特种金融债券；在债券到期前30 天将债券本息一次性划至中央国债登记结算有限责任公司；以所抵押的资产抵债。
发债机构要求以其持有的国债、政策性金融债券、中央银行融资券置换特种金融债券的，必须向中国人民银行提出申请，置换办法、置换比例和置换期限须经中国人民银行批准后，于实施前91天向社会公告，按自愿原则向特种金融债券债权人办理置换，并通过中央国债登记结算有限责任公司办理有关手续。特种金融债券债权人如不同意置换，发债机构应按其他偿付办法还本付息。置换期间，该特种金融债券不得再用于回购交易。
若被置换的特种金融债券超过该种债券回购交易流通部分的75%，应予以公告。已签署的剩余部分特种金融债券的回购协议继续有效，回购双方的债权债务到期交付回购协议利差后，由发债机构负责债券的到期兑付。
发债机构
发债机构要求分期赎回特种金融债券的，须经中国人民银行批准后提前91天向社会公告。发债机构要与债券持有人签订“特种金融债券赎回协议”，自公告之日起，停止新的特种金融债券回购业务。第一期赎回的特种金融债券不得少于该债券在回购市场上按面值计算的总额的20%，至特种金融债券到期前30天，赎回的特种金融债券不得少于该债券在回购市场上按面值计算的总额的75%。赎回的特种金融债券达到该债券在回购市场上按面值计算的总额的75%时，该特种金融债券应停止回购交易。已签署的剩余部分特种金融债券的回购协议继续有效，回购双方的债权债务到期交付回购协议利差后，由发债机构负责债券的到期兑付。每一次赎回都必须公告。
没有提出以国债、政策性金融债券、中央银行融资券置换特种金融债券和提前赎回特种金融债券申请，或者以国债、政策性金融债券、中央银行融资券置换特种金融债券金额与提前赎回金额之和不足以偿还全部到期债务的，发债机构必须在特种金融债券期满前30天，将尚未兑付的债券本息划至中央国债登记结算有限责任公司，该笔款项必须入偿债基金专户存储，偿债基金按金融机构存款利率计息。特种金融债券到期前7天(不含7天)，特种金融债券在回购市场停止交易，在停止交易期间到期的特种金融债券回购协议仍然有效，中央国债登记结算有限责任公司代为进行资金清算，兑付到期债券本息。
既没有提出以国债、政策性金融债券、中央银行融资券置换特种金融债券申请和提前赎回债券申请，也没有在规定日期前将债券本息划至中央国债登记结算有限责任公司的，或者以国债、政策性金融债券、中央银行融资券置换金额、提前赎回金额、划至中央国债登记结算有限责任公司的债券本息之和不足以偿还全部到期债务的，中央国债登记结算有限责任公司可先用其缴存的偿债基金对债务进行清偿，以偿债基金清理债务后的不足部分，中央国债登记结算有限责任公司可根据与发债机构签订的资产抵押合同，以发债机构或发债机构的担保人所抵押的资产抵债。如发债机构和其担保人的抵押资产不足抵偿发债机构债务，其剩余债务偿还责任仍由发债机构和其担保人承担。
特种金融债券兑付完毕后，发债机构必须在中国人民银行总行指定的报纸上公告。
申请材料
申请发行特种金融债券，要向中国人民银行报送以下材料：
发行特种金融债券的申请（地方性公司发行特种金融债券的申请由分行转报总行）；
经交易场所确认的证券回购债务余额；
公司董事会同意发行特种金融债券的决议；
特种金融债券发行章程；
公司长期资产产权证明材料；
公司近三年的财务审计报告；
担保协议或中央国债登记结算有限责任公司（简称中央结算公司）出具的发债机构资产抵（质）押手续已办妥的证明；
担保人近一年的资产负债表损益表；
企业法人代表签署的清偿回购债务承诺书；
公司证券回购债务清偿计划；
公司及担保人的金融机构法人许可证营业执照副本复印件。