畜禽遗传资源保护全称国家畜禽遗传资源保护制度，是一项极其复杂的庞大系统工程，它包括国家畜禽遗传资源（物种）保护制度、国家畜禽遗传资源调查制度、国家畜禽遗传资源状况报告定期发布制度、全国畜禽遗传资源保护规划、保护名录、禽畜遗传资源的鉴定、评估制度、畜禽遗传资源分级管理制度、进出口管理制度等，目的是保护国家食物安全和经济产业安全，保护优秀畜禽遗传资源，不仅符合中国人民的利益，也符合世界人民的利益，优秀畜禽遗传资源，是保证中国人民和世界人民食物安全的重要保障。
基本信息
【注音】chùqínyíchuānzīyuánbǎohù
【释义】是畜禽遗传资源保护制度的内容。
制度建设
2005年12月全国人民代表大会常务委员会通过的《
中华人民共和国畜牧法》规定，“国家建立畜禽遗传资源保护制度。各级人民政府应当采取措施，加强畜禽遗传资源保护，畜禽遗传资源保护经费列入财政预算。
……畜禽遗传资源保护以国家为主，鼓励和支持有关单位、个人依法发展畜禽遗传资源保护事业。”
……“国务院畜牧兽医行政主管部门设立由专业人员组成的国家畜禽遗传资源委员会，负责畜禽遗传资源的鉴定、评估和畜禽新品种、配套系的审定，承担畜禽遗传资源保护和利用规划论证及有关畜禽遗传资源保护的咨询工作。”
“国务院畜牧兽医行政主管部门负责组织畜禽遗传资源的调查工作，发布国家畜禽遗传资源状况报告，公布经国务院批准的畜禽遗传资源目录。”
“国务院畜牧兽医行政主管部门根据畜禽遗传资源分布状况，制定全国畜禽遗传资源保护和利用规划，制定并公布国家级畜禽遗传资源保护名录，对原产我国的珍贵、稀有、濒危的畜禽遗传资源实行重点保护。省级人民政府畜牧兽医行政主管部门根据全国畜禽遗传资源保护和利用规划及本行政区域内畜禽遗传资源状况，制定和公布省级畜禽遗传资源保护名录，并报国务院畜牧兽医行政主管部门备案。”
“国务院畜牧兽医行政主管部门根据全国畜禽遗传资源保护和利用规划及国家级畜禽遗传资源保护名录，省级人民政府畜牧兽医行政主管部门根据省级畜禽遗传资源保护名录，分别建立或者确定畜禽遗传资源保种场、保护区和基因库，承担畜禽遗传资源保护任务。享受中央和省级财政资金支持的畜禽遗传资源保种场、保护区和基因库，未经国务院畜牧兽医行政主管部门或者省级人民政府畜牧兽医行政主管部门批准，不得擅自处理受保护的畜禽遗传资源。
畜禽遗传资源基因库应当按照国务院畜牧兽医行政主管部门或者省级人民政府畜牧兽医行政主管部门的规定，定期采集和更新畜禽遗传材料。有关单位、个人应当配合畜禽遗传资源基因库采集畜禽遗传材料，并有权获得适当的经济补偿。
畜禽遗传资源保种场、保护区和基因库的管理办法由国务院畜牧兽医行政主管部门制定。”等事项。
保护名录
一、猪
八眉猪、大花白猪、马身猪、淮猪、莱芜猪、内江猪、乌金猪（大河猪）、五指山猪、二花脸猪、梅山猪、民猪、两广小花猪（陆川猪）、里岔黑猪、金华猪、荣昌猪、香猪、华中两头乌猪（沙子岭猪、通城猪、监利猪）、清平猪、滇南小耳猪、槐猪、蓝塘猪、藏猪、浦东白猪、撒坝猪、湘西黑猪、大蒲莲猪、巴马香猪、玉江猪（玉山黑猪）、姜曲海猪、粤东黑猪、汉江黑猪、安庆六白猪、莆田黑猪、嵊县花猪、宁乡猪、米猪、皖南黑猪、沙乌头猪、乐平猪、海南猪（屯昌猪）、嘉兴黑猪、大围子猪
二、鸡
大骨鸡、白耳黄鸡、仙居鸡、北京油鸡、丝羽乌骨鸡、茶花鸡、狼山鸡、清远麻鸡、藏鸡、矮脚鸡、浦东鸡、溧阳鸡、文昌鸡、惠阳胡须鸡、河田鸡、边鸡、金阳丝毛鸡、静原鸡、瓢鸡、林甸鸡、怀乡鸡、鹿苑鸡、龙胜凤鸡、汶上芦花鸡、闽清毛脚鸡、长顺绿壳蛋鸡、拜城油鸡、双莲鸡
三、鸭
北京鸭、攸县麻鸭、连城白鸭、建昌鸭、金定鸭、绍兴鸭、莆田黑鸭、高邮鸭、缙云麻鸭、吉安红毛鸭
四、鹅
四川白鹅、伊犁鹅、狮头鹅、皖西白鹅、豁眼鹅、太湖鹅、兴国灰鹅、乌鬃鹅、浙东白鹅、钢鹅、溆浦鹅
五、牛马驼
九龙牦牛、天祝白牦牛、青海高原牦牛、甘南牦牛、独龙牛（大额牛）、海子水牛、温州水牛、槟榔江水牛、延边牛、复州牛、南阳牛、秦川牛、晋南牛、渤海黑牛、鲁西牛、温岭高峰牛、蒙古牛、雷琼牛、郏县红牛、巫陵牛（湘西牛）、帕里牦牛、德保矮马、蒙古马、鄂伦春马、晋江马、宁强马、岔口驿马、焉耆马、关中驴、德州驴、广灵驴、泌阳驴、新疆驴、阿拉善双峰驼
六、羊
辽宁绒山羊、内蒙古绒山羊（阿尔巴斯型、阿拉善型、二狼山型）、小尾寒羊、中卫山羊、长江三角洲白山羊（笔料毛型）、乌珠穆沁羊、同羊、西藏羊（草地型）、西藏山羊、济宁青山羊、贵德黑裘皮羊、湖羊、滩羊、雷州山羊、和田羊、大尾寒羊、多浪羊、兰州大尾羊、汉中绵羊、岷县黑裘皮羊、苏尼特羊、成都麻羊、龙陵黄山羊、太行山羊、莱芜黑山羊、牙山黑绒山羊、大足黑山羊
七、其他品种
敖鲁古雅驯鹿、吉林梅花鹿、中蜂、东北黑蜂、新疆黑蜂、福建黄兔、四川白兔
法制建设
“十一五”期间，国家颁布实施了《畜牧法》，出台了《畜禽遗传资源进出境和对外合作研究利用审批办法》、《畜禽遗传资源保种场保护区和基因库管理办法》等10个配套法规。《畜牧法》及其配套法规的颁布实施，是畜禽遗传资源保护法制建设的重要里程碑。《畜牧法》明确提出了国家建立畜禽遗传资源保护制度，畜禽遗传资源保护经费列入财政预算，为全面加强畜禽遗传资源保护和管理提供了坚实的法律保障。
资源调查
资源调查工作
新中国第一次开展全国性的畜禽遗传资源调查是在上世纪七、八十年代。为摸清资源最新状况，农业部在“十一五”期间组织完成了第二次全国畜禽遗传资源调查。据不完全统计，各地共组织6900多人，投入4500余万元，调查了1200余个畜禽品种（类型），历时5年完成了资源调查和数据分析，掌握了大量第一手资料，摸清了现阶段我国畜禽遗传资源状况。通过调查，发现了槟榔江水牛等86个新资源，对“同名异种”等问题进行了科学界定，品种数量增加300多个。调查中有15个地方畜禽品种资源未发现，超过一半以上的地方品种的群体数量呈下降趋势。在资源调查的基础上，历时两年，编纂完成了《中国畜禽遗传资源志》，志书共分7卷，其中《蜜蜂志》和《特种畜禽志》为国内首次出版。志书系统论述了畜种的起源、演变，品种形成的历史，详细介绍了每个品种的产地分布、外貌特征、生产性能、保护利用状况及展望等，对于产业发展、科学研究、人才培养具有重要的参考价值。
资源现状
据农业部2004～2008年全国畜禽遗传资源调查，我国有畜禽品种、配套系901个，其中地方品种554个。这些地方品种普遍具有繁殖力高、肉质鲜美、适应性强、耐粗饲等优良特性，有的还具有药用、竞技等价值，是培育新品种不可缺少的原始素材，是我国畜牧业可持续发展的宝贵资源。
国际交流和合作
作为畜禽资源大国，中国是最早签署和加入《生物多样性公约》的国家之一，是联合国粮农组织畜禽遗传资源管理委员会政府间技术工作组26个成员国之一，全面参与制定了《动物遗传资源保护与管理全球行动计划》、《因特拉肯宣言》等，参与了《世界动物遗传资源状况》的编写工作和《动物遗传资源调查技术手册》的起草工作，积极履行我国承担的责任和任务，提交了《中国畜禽遗传资源状况》（国别报告），主持了亚洲地区区域磋商，承办了亚洲地区动物遗传资源技术研讨会等。
分级保护
中央和地方政府在畜禽遗传资源保护中的责任；要按照权限和地理区域的不同，针对每一级别的单位，实施不同的权力，承担不同的责任和义务。
同时将遗传资源基因库、保种场、保护区作为畜禽遗传资源的主要保护手段。
进出境管理
面临着日益增多的畜禽遗传资源流失海外的窘境，中国需要对畜禽遗传资源的进出境管理做出了明确规定。境外机构、个人取得原生中国的畜禽资源必须经过有关部门批准，对其中国家级畜禽遗传资源保护名录中的畜禽资源，中国要按照共享惠益原则分享研究和开发畜禽遗传资源所获得的利益。 严格谨慎管理物种的进口与出口，既不要让中国物种出口形成对外国生态和物种的污染，也不要随意接受别国物种对中国生态和物种的破坏和污染。如有一些不具备科研和资金条件的单位或个人，盲目从国外引进国内还没有的物种，如食人鱼的引进在中国形成物种污染，对中国鱼类的生存产生了长期威胁；也有美国人引进中国鲤鱼鲫鱼到美国河流中，结果对美国水生态和鱼类形成威胁。
问题困难
长期以来，由于单纯追求畜禽产品的数量，缺乏对禽畜遗传资源重要性的认识，盲目利用，忽视保护，加之保护手段落后，投入不足，致使畜禽品种数量骤减。中国是世界上畜禽遗传资源最丰富的国家之一，约占世界畜禽遗传资源总量的六分之一，有畜禽品种、类群576个。但近20年来，中国已有10多个畜禽品种绝迹，20多个品种濒危，百余个品种数量急剧下降。优秀物种资源的消失，给中国和世界的食物安全造成了不利影响。
同时还面临着日益增多的畜禽遗传资源流失海外的窘境，国际不法商人，以科研交流、私人爱好等为借口，从国内盗窃、走私优秀物种基因，破坏中国畜禽遗传资源。
国内还存在着法制意识单薄，缺少有法可依，对于国家食物安全和经济产业安全缺少清醒认识等不利情况。