第三世代

任天堂新型掌机GBA终于在万众期待中推出了，可是迟迟都没有正统宝可梦的消息。最后终于在2002年11月12日发售。本次宝可梦画面变化很大，借助着GBA强大的机能，使宝可梦又提高到了一个新的境界。宝可梦也从251个再次提升到386个，这次宝可梦取消了黑夜白天的设计，加入了时钟的概念。新的丰缘地区，新的敌人熔岩队和海洋队，新的人物，新的故事，新的神兽，新的双主角。新增加了2V2的战斗，增加了宝可梦华丽大赛和秘密基地。这一系列新的要素造就了《宝可梦红宝石·蓝宝石》在GBA上的成功。为了弥补GBA不能和前代掌机联机交换宝可梦的弊端，2004年发售了开山之作《宝可梦红·绿》的复刻版——《宝可梦火红·叶绿》。这次的复刻版除了画面的飞跃之外，还增加了新的七岛地图和无线联机，同时增加了部分《宝可梦金·银》的宝可梦的捕捉地点（当然有些还是需要官方活动）。《宝可梦火红·叶绿》通关后可与《宝可梦红宝石·蓝宝石》联机交换宝可梦。而后发售的《宝可梦绿宝石》则是《宝可梦红宝石·蓝宝石》的加强版，新增加和改动了部分剧情，无线联机，部分道馆馆主发生变化，增加了一段关于固拉多和盖欧卡的海陆大战的剧情，同时增加烈空坐的剧情，当然最吸引人的则是通关后的对战天堂——对战开拓区。

系列特点

（与第二世代相比）

对应的游戏世界为丰缘地区。新增了135只宝可梦，宝可梦总数达到386只。新增了103个新技能，技能总数达到354个。宝可梦的特攻与特防彻底完全分离，特殊能力不再使用。新增了特性系统，特性总数为77个，每只宝可梦获得一至二个特性。增加了冰雹天气。双打对战出现。树果系统大幅改进。

系列细节

官方并没有第几世代的称呼，第几世代是宝可梦的爱好者之间互相讨论时所使用的词。在中国一般以宝石版、火叶、宝石世代或者386来指代第三世代。

和第二世代保留前作地图的做法不同，第三世代从地图到宝可梦都是全新的。但是游戏中会有前作的宝可梦出现。

第三世代与之前世代的地图和故事上完全分离，主角无法前往前世代的地区。

本世代首次出现地区图鉴的概念，地区图鉴并不包含所有的宝可梦。

第二世代和第三世代之间是第一次出现两个世代之间没有任何跨世代传送宝可梦的方式。

在《宝可梦红宝石·蓝宝石》发售时，一些前两个世代的宝可梦虽然存在于游戏数据中，但无法透过正常途径获得，直至宝可梦圆形竞技场及《宝可梦火红·叶绿》的发售才以让这些宝可梦正式在第三世代出现。

这种情况造成了凤王和洛奇亚这两只宝可梦从《宝可梦红宝石·蓝宝石》直到《宝可梦心金·魂银》之前都只能通过官方活动或者与旁支系列游戏联动才可以得到，这段时间内也被官方称为幻之宝可梦。

第三世代及其重制版的传说的宝可梦的体系可能是建立在希伯来神话和诺斯底主义的基础之上。